The manuscript you submitted to the journal should be your favorite version - the way to tell the story, the point you wanna make, etc.
However, usually not everyone agrees with you and has their own thought on how the paper should be written.
Then, it comes to a point of decision. Every change you made, it takes one step away from your favorite storyline, and makes you love your paper a bit less.
Words on the street spread really fast. Now we know the identities of two reviewers. Kind of lucky to have a very friendly and helpful one in it.
Thursday, March 13, 2008
Sunday, March 9, 2008
約翰哈佛像
學校裡 old yard 的銅像總是觀光客聚集拍照留念的熱門景點，每個到訪的人大概都會去合照一下。
這是第一年還住在 Fenway Park 的時候，冰天雪地到 Cambridge campus 上課隨手拍的。
凡凡在校園旁邊住了快兩年了，連一張合照的相片都沒有，為了補上帶凡凡到了 old yard，只是凡凡實在是不夠高，只好拉到遠遠的地方，合拍入鏡意思一下。
凡凡甚麼也不懂，看到 old yard 一直跑來跑去。
這是第一年還住在 Fenway Park 的時候，冰天雪地到 Cambridge campus 上課隨手拍的。
凡凡在校園旁邊住了快兩年了，連一張合照的相片都沒有，為了補上帶凡凡到了 old yard，只是凡凡實在是不夠高，只好拉到遠遠的地方，合拍入鏡意思一下。
凡凡甚麼也不懂，看到 old yard 一直跑來跑去。
Friday, March 7, 2008
Non-Robust Systems
This Friday's theory lunch was about using mathematics to quantify the robustness. Basically, the definition of robustness can be considered as a function of input and output.
After back to the lab, we talked about examples in real lives which are robust and non-robust. Just like biology which is very robust, almost every artificial system needs to be robust to functioning well. Thus it is quite easy to find robust systems around us, but probably not for opposed ones.
I thought about one example - the paper peer-reviewing process actually is a very non-robust system. It's pretty unpredictable. Even for the same manuscript (input) sending to the same journal twice, it is not guaranteed the decisions (output) will be always the same. And even worse, this system is very easy to be interfered by outside perturbations. Say, some powerful PIs directly write or call editors arguing the reviews or decisions.
I think it could be one of the best examples in real lives for non-robust systems .
After back to the lab, we talked about examples in real lives which are robust and non-robust. Just like biology which is very robust, almost every artificial system needs to be robust to functioning well. Thus it is quite easy to find robust systems around us, but probably not for opposed ones.
I thought about one example - the paper peer-reviewing process actually is a very non-robust system. It's pretty unpredictable. Even for the same manuscript (input) sending to the same journal twice, it is not guaranteed the decisions (output) will be always the same. And even worse, this system is very easy to be interfered by outside perturbations. Say, some powerful PIs directly write or call editors arguing the reviews or decisions.
I think it could be one of the best examples in real lives for non-robust systems .
Wednesday, March 5, 2008
中文托福
這幾天我把讓 search engine 搜尋的功能關閉了，這樣子 Marc 的 video 就不會出現在 google 這些搜尋引擎的結果裡。剛剛去後台把功能重新開啟的時候，發現原來 blogger 新提供了翻譯功能，不過選擇很少，也沒有中文。
這功能讓我想到了一個有關中文托福老笑話，可能很多人都看過聽過了。有些題目有點無聊，有幾題還蠻好笑的。
這裡面的笑點，有親身考過托福的人最能體會，感覺就像是托福考題一樣。
--
你知道中文托福考嗎？
教育部在 4月14日決定 2年內建置首套中文能力測驗制度。
也就是說教部要開辦中文托福考了！
教育部應該要來參考一下這幾題中文能力測驗，
同時舉辦一個全民中文托福考題徵選，
考死那些外國人！
讓外國人也體會一下我們在準備托福時的痛苦。
第一題
男：我給你看李小姐的照片，她的外型很不錯。
女：看你的大頭啦！
從這個女人的談話，我們可以得到什麼結論？
甲、她是腦神經外科醫生。
乙、她比較喜歡那個男人的頭。
丙、她覺得不耐煩且沒有興趣。
丁、這女人在吃醋。
第二題
女：你去臺東玩，覺得如何？
男：臺東好不熱鬧，我玩的好不快樂。
這男人是什麼意思？
甲、臺東人多擁擠，我玩的好不快樂。
乙、臺東很冷清，他很快樂。
丙、臺東很繁榮，他在那很愜意。
丁、臺東很荒涼，他很落漠。
第三題
女：好久不見，你還沒死啊？
男：「恁北」好得很！
這男人在說什麼？
甲、女人的爸爸身體健康。
乙、他的脾氣很好。
丙、他過的不錯。
丁、女人的爸爸過得很好。
第四題
男：你想要看那一台啦？
女：你們家有第四台嗎？
從這個女人的談話，我們可以得到什麼結論？
甲、她希望她家有第四台電視機。
乙、她想看四號頻道。
丙、她想看有線電視。
丁、她想看鎖碼台。
第五題
女：這次的遠東區少棒賽結果如何？
男：結果中華大勝南韓，中華又大敗日本。
這場比賽的結果到底誰是冠軍？
甲、中華。
乙、日本。
丙、南韓。
丁、三隊戰績相同，必須加賽才能分出勝負。
第六題
女：你不喜歡跟我去逛街？
男：對啊！妳現在才知道。
甲、他不喜歡逛街。
乙、他喜歡逛街。
丙、他覺得她早知道。
丁、他自己也不知道。
第七題
女：你跟她見面之後如何？
男：她放我鴿子啦！
由上面這段對話，我們可以得到什麼結論？
甲、他們都很喜歡鳥類。
乙、他們一起去放生。
丙、他覺得她是個不錯的女孩。
丁、他們根本就沒見面。
第八題
男：我們工廠最近連續三個晚上加班趕工！好累喔！
女：你的工作實在太辛苦了！
請問這名男子的工作狀況？
甲、日以繼夜。
乙、夜以繼日。
丙、日夜顛倒。
丁、日積月累。
戊、夜不閉戶。
第九題
女：我們公司上下班都很正常，不會辛苦啦！
男：那我就放心了！
請問這名女子的工作狀況？
甲、朝三暮四。
乙、朝九晚五。
丙、朝令夕改。
丁、三令五申。
戊、日上三竿。
第十題
陳先生：這次比賽我一定會贏你！
吳先生：是喔！最好是這樣啦！
請解釋吳先生的意思。
甲、為陳先生祝福。
乙、替陳先生打氣。
丙、有本事再說。
丁、覺得陳先生贏是最好的結果。
第十一題
男：嗨！我來了！
女：都快一點了ㄟ！
請問女孩說這句話的心情？
甲、高興；男孩早到了。
乙、著急；叫男孩快一點。
丙、興奮；男孩和女孩都快了一點。
丁、生氣；男孩沒有準時到。
第十二題
男：怎麼了？
女：討厭死了！一天到晚都找不到你的人！
這女孩說的話，代表了什麼意思呢？
甲、女孩已經找了男孩一整天。
乙、女孩覺得男孩很難找。
丙、有一天晚上女孩找不到男孩的朋友。
丁、白天和晚上都找不到男孩的朋友。
第十三題
女：你說啊！你到底去了哪裡？
男：我什麼都不會說。
這男孩說的話，是什麼意思？
甲、男孩不會說答案。
乙、男孩不能說答案。
丙、男孩不願說答案。
丁、男孩不應說答案。
第十四題
男：小姐，請問這件衣服怎麼賣？
女：三百，算你八折就好了！
男：二百啦！
女：你二百五啊！
請問最後這件衣服到底多少錢？
甲、六十元。
乙、二百元。
丙、二百四十元。
丁、二百五十元。
第十五題
試想下列問題小姐應該如何回答最正確？
老闆：小姐，請問妳叫什麼？
甲、我叫蔡翠秋，你呢？
乙、你耳朵有問題啊？我沒有叫啊！
丙、來一盤豆干、一碗陽春麵。
丁、我叫天天不應，叫地地不靈。
第十六題
女：哇塞！老闆，你們的臭豆腐好臭喔！
請問老闆應該如何回答最正確？
甲、那妳不要吃啊！
乙、謝謝！大家都這樣說！
丙、對不起，我馬上幫妳換一盤。
丁、不會啊！這很新鮮 ！
第十七題
收機鈴響聲。
男：喔！賣卡啊啦！
以下敘述何者不正確？
甲、男子叫對方不要催了。
乙、對方連續打過一次以上的電話給男子。
丙、男子的電話 SIM卡賣掉了。
丁、男子的電話收訊正常。
第十八題
陳先生、吳先生、張先生、趙先生在一起打麻將。
陳：二筒，碰！
吳：可惡！二筒又被你碰掉了！
張：別氣別氣，來片波卡洋芋片啦！
王：我吃！
請問王先生吃了什麼？
甲、二筒。
乙、波卡洋芋片。
丙、上家打出來的牌。
丁、沒吃東西。
第十九題
續上題。
陳：換誰啦！
吳：換我啦！
張：換你就快打啊！每次都是你最慢！
吳：賽給你啦！
請問吳先生做了什麼？
甲、回罵張先生。
乙、打了一張西風。
丙、拉了一坨屎給張先生。
丁、呼了張先生一巴掌。
第二十題
弟弟：我回來了！爸媽呢？
姊姊：在麻將桌上。
根據姊姊的回答，以下敘述何者有誤？
甲、爸爸媽媽在打麻將。
乙、爸爸媽媽坐在椅子上。
丙、爸爸媽媽身旁一定有其他人。
丁、爸爸媽媽在麻將桌上。
這功能讓我想到了一個有關中文托福老笑話，可能很多人都看過聽過了。有些題目有點無聊，有幾題還蠻好笑的。
這裡面的笑點，有親身考過托福的人最能體會，感覺就像是托福考題一樣。
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你知道中文托福考嗎？
教育部在 4月14日決定 2年內建置首套中文能力測驗制度。
也就是說教部要開辦中文托福考了！
教育部應該要來參考一下這幾題中文能力測驗，
同時舉辦一個全民中文托福考題徵選，
考死那些外國人！
讓外國人也體會一下我們在準備托福時的痛苦。
第一題
男：我給你看李小姐的照片，她的外型很不錯。
女：看你的大頭啦！
從這個女人的談話，我們可以得到什麼結論？
甲、她是腦神經外科醫生。
乙、她比較喜歡那個男人的頭。
丙、她覺得不耐煩且沒有興趣。
丁、這女人在吃醋。
第二題
女：你去臺東玩，覺得如何？
男：臺東好不熱鬧，我玩的好不快樂。
這男人是什麼意思？
甲、臺東人多擁擠，我玩的好不快樂。
乙、臺東很冷清，他很快樂。
丙、臺東很繁榮，他在那很愜意。
丁、臺東很荒涼，他很落漠。
第三題
女：好久不見，你還沒死啊？
男：「恁北」好得很！
這男人在說什麼？
甲、女人的爸爸身體健康。
乙、他的脾氣很好。
丙、他過的不錯。
丁、女人的爸爸過得很好。
第四題
男：你想要看那一台啦？
女：你們家有第四台嗎？
從這個女人的談話，我們可以得到什麼結論？
甲、她希望她家有第四台電視機。
乙、她想看四號頻道。
丙、她想看有線電視。
丁、她想看鎖碼台。
第五題
女：這次的遠東區少棒賽結果如何？
男：結果中華大勝南韓，中華又大敗日本。
這場比賽的結果到底誰是冠軍？
甲、中華。
乙、日本。
丙、南韓。
丁、三隊戰績相同，必須加賽才能分出勝負。
第六題
女：你不喜歡跟我去逛街？
男：對啊！妳現在才知道。
甲、他不喜歡逛街。
乙、他喜歡逛街。
丙、他覺得她早知道。
丁、他自己也不知道。
第七題
女：你跟她見面之後如何？
男：她放我鴿子啦！
由上面這段對話，我們可以得到什麼結論？
甲、他們都很喜歡鳥類。
乙、他們一起去放生。
丙、他覺得她是個不錯的女孩。
丁、他們根本就沒見面。
第八題
男：我們工廠最近連續三個晚上加班趕工！好累喔！
女：你的工作實在太辛苦了！
請問這名男子的工作狀況？
甲、日以繼夜。
乙、夜以繼日。
丙、日夜顛倒。
丁、日積月累。
戊、夜不閉戶。
第九題
女：我們公司上下班都很正常，不會辛苦啦！
男：那我就放心了！
請問這名女子的工作狀況？
甲、朝三暮四。
乙、朝九晚五。
丙、朝令夕改。
丁、三令五申。
戊、日上三竿。
第十題
陳先生：這次比賽我一定會贏你！
吳先生：是喔！最好是這樣啦！
請解釋吳先生的意思。
甲、為陳先生祝福。
乙、替陳先生打氣。
丙、有本事再說。
丁、覺得陳先生贏是最好的結果。
第十一題
男：嗨！我來了！
女：都快一點了ㄟ！
請問女孩說這句話的心情？
甲、高興；男孩早到了。
乙、著急；叫男孩快一點。
丙、興奮；男孩和女孩都快了一點。
丁、生氣；男孩沒有準時到。
第十二題
男：怎麼了？
女：討厭死了！一天到晚都找不到你的人！
這女孩說的話，代表了什麼意思呢？
甲、女孩已經找了男孩一整天。
乙、女孩覺得男孩很難找。
丙、有一天晚上女孩找不到男孩的朋友。
丁、白天和晚上都找不到男孩的朋友。
第十三題
女：你說啊！你到底去了哪裡？
男：我什麼都不會說。
這男孩說的話，是什麼意思？
甲、男孩不會說答案。
乙、男孩不能說答案。
丙、男孩不願說答案。
丁、男孩不應說答案。
第十四題
男：小姐，請問這件衣服怎麼賣？
女：三百，算你八折就好了！
男：二百啦！
女：你二百五啊！
請問最後這件衣服到底多少錢？
甲、六十元。
乙、二百元。
丙、二百四十元。
丁、二百五十元。
第十五題
試想下列問題小姐應該如何回答最正確？
老闆：小姐，請問妳叫什麼？
甲、我叫蔡翠秋，你呢？
乙、你耳朵有問題啊？我沒有叫啊！
丙、來一盤豆干、一碗陽春麵。
丁、我叫天天不應，叫地地不靈。
第十六題
女：哇塞！老闆，你們的臭豆腐好臭喔！
請問老闆應該如何回答最正確？
甲、那妳不要吃啊！
乙、謝謝！大家都這樣說！
丙、對不起，我馬上幫妳換一盤。
丁、不會啊！這很新鮮 ！
第十七題
收機鈴響聲。
男：喔！賣卡啊啦！
以下敘述何者不正確？
甲、男子叫對方不要催了。
乙、對方連續打過一次以上的電話給男子。
丙、男子的電話 SIM卡賣掉了。
丁、男子的電話收訊正常。
第十八題
陳先生、吳先生、張先生、趙先生在一起打麻將。
陳：二筒，碰！
吳：可惡！二筒又被你碰掉了！
張：別氣別氣，來片波卡洋芋片啦！
王：我吃！
請問王先生吃了什麼？
甲、二筒。
乙、波卡洋芋片。
丙、上家打出來的牌。
丁、沒吃東西。
第十九題
續上題。
陳：換誰啦！
吳：換我啦！
張：換你就快打啊！每次都是你最慢！
吳：賽給你啦！
請問吳先生做了什麼？
甲、回罵張先生。
乙、打了一張西風。
丙、拉了一坨屎給張先生。
丁、呼了張先生一巴掌。
第二十題
弟弟：我回來了！爸媽呢？
姊姊：在麻將桌上。
根據姊姊的回答，以下敘述何者有誤？
甲、爸爸媽媽在打麻將。
乙、爸爸媽媽坐在椅子上。
丙、爸爸媽媽身旁一定有其他人。
丁、爸爸媽媽在麻將桌上。
Tuesday, March 4, 2008
Dilemma for Requests
When I was in Taiwan, I always thought things are different when you are in a big famous lab asking reagents from others. People would reply you rapidly and generously send you antibodies, plasmids, or cell lines you want.
But, now I am in a big famous lab (as least I think so .. :) ), and things seems to be not any better. Recently I wrote emails to 4 labs asking their GFP constructs of microtubule plus end proteins, to reveal the dark region in the midzone where antibodies cannot penetrate. None of these labs replys.
Initially I was thinking probably there was something wrong in my writing or wording. So I asked Aaron. Aaron said it happens all the time, especially to our lab. Sometime people are busy thus ignored the requests. But most of the time, people in the similar field are just not willing to share their reagents to a lab in top institutes, worry about being out-competited for potential conflicts.
Usually we can easily got reagents from friends, which we have plenty in our fields. But once outside the circle, things become difficult, probabaly more difficult than others, unfortunately.
Seems eventually I have to clone it by myself... sigh...
But, now I am in a big famous lab (as least I think so .. :) ), and things seems to be not any better. Recently I wrote emails to 4 labs asking their GFP constructs of microtubule plus end proteins, to reveal the dark region in the midzone where antibodies cannot penetrate. None of these labs replys.
Initially I was thinking probably there was something wrong in my writing or wording. So I asked Aaron. Aaron said it happens all the time, especially to our lab. Sometime people are busy thus ignored the requests. But most of the time, people in the similar field are just not willing to share their reagents to a lab in top institutes, worry about being out-competited for potential conflicts.
Usually we can easily got reagents from friends, which we have plenty in our fields. But once outside the circle, things become difficult, probabaly more difficult than others, unfortunately.
Seems eventually I have to clone it by myself... sigh...
Monday, March 3, 2008
Sunday, March 2, 2008
連爬帶滾
冬春之際，新英格蘭的天氣就是下雨降雪出太陽這樣交替輪流著，禮拜六下了大雪，禮拜天就出大太陽了。趁著陽光把凡凡帶出去活動一下。
學校的校園每年不斷向外擴展，在靠近我們住的地方的這一側，去年又有大批民房被學校買了起來，改建了批應該是政府學院地下的地區研究中心。新建的房子都很漂亮，規劃得也很好，凡凡也常來玩。
中東研究中心旁有個向陽的斜坡，昨天的雪在這一面已經全部融光了，露出草皮剛好可以讓凡凡活動。就讓凡凡爬爬這斜坡，不過大概是風太強，走沒兩步就連爬帶滾地滾下去。
多試幾次抓到要領，就好多了，上去之後更好玩地就是從斜坡衝下來，凡凡特愛這個。
衝下來瞬間特寫一
衝下來瞬間特寫二
最後不曉得是累了還是想做日光浴，找到地方就躺了下去，還知道要喬一下位置讓自己舒服一點。
學校的校園每年不斷向外擴展，在靠近我們住的地方的這一側，去年又有大批民房被學校買了起來，改建了批應該是政府學院地下的地區研究中心。新建的房子都很漂亮，規劃得也很好，凡凡也常來玩。
中東研究中心旁有個向陽的斜坡，昨天的雪在這一面已經全部融光了，露出草皮剛好可以讓凡凡活動。就讓凡凡爬爬這斜坡，不過大概是風太強，走沒兩步就連爬帶滾地滾下去。
多試幾次抓到要領，就好多了，上去之後更好玩地就是從斜坡衝下來，凡凡特愛這個。
衝下來瞬間特寫一
衝下來瞬間特寫二
最後不曉得是累了還是想做日光浴，找到地方就躺了下去，還知道要喬一下位置讓自己舒服一點。
Saturday, March 1, 2008
Free Space on the Internet
Months ago, Ting asked me if I know any free internet space for data storage and/or paper sharing. I said Gmail, but we both agreed it is inconvenient.
I just found a website called eSnips which could be very useful for us. eSnips provides 5GB free space. You could upload and share anything, as long as not over 100MB per file.
Yeah, I know 5GB is not that big...
My microscopy image files so far are over 700GB already, and even FanFan's pictures are about 23GB. However, it is a free 5GB, why not? Or anyone knows other better places?
I have not tried it yet, but plan to do so soon.
I just found a website called eSnips which could be very useful for us. eSnips provides 5GB free space. You could upload and share anything, as long as not over 100MB per file.
Yeah, I know 5GB is not that big...
My microscopy image files so far are over 700GB already, and even FanFan's pictures are about 23GB. However, it is a free 5GB, why not? Or anyone knows other better places?
I have not tried it yet, but plan to do so soon.
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